全基因组的宿主通路相互作用影响酵母酵母中的cis-cis-muconic酸生产
Paul Cachera1, Nikolaj Can Kurt2, Andreas Røpke2
1Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, Kgs. Lyngby, Denmark.
Metabolic engineering
|March 1, 2024
概括
我们改进了一种高通量基因编辑方法 (CRI-SPA),绘制了酵母菌中cis-cis-酸 (CCM) 生产的主机:通路相互作用的地图. 这种方法确定了新的目标,并揭示了CCM生物合成和细胞氧化还原之间的联系.
科学领域:
- 代谢工程是代谢工程.
- 合成生物学 合成生物学
- 酵母系统生物学 酵母系统生物学
背景情况:
- 前进的代谢工程需要了解宿主中异质途径的行为.
- 像CRI-SPA这样的当前高吞吐量方法受到产品表型的限制.
- 需要一种研究无色产品的方法来扩大途径分析.
研究的目的:
- 适应CRI-SPA用于分析无色产品生物合成.
- 为了创建一个全基因组的宿主地图: cis-cis-酸 (CCM) 的途径相互作用.
- 确定影响CCM生产的新型宿主因素.
主要方法:
- 适应的CRI-SPA带有生物传感器用于CCM生产.
- 现型化超过9000种酵母基因型 (敲除和过度表达).
- 在高密度阿加阵列中量化生物传感器光.
主要成果:
- 识别了跨多种细胞功能影响CCM生物合成的新型代谢标.
- 确认了确定目标对CCM生产的积极影响.
- 通过氧化酸盐酸盐路径发现了CCM生物合成和细胞质氧化还原之间的相互作用.
结论:
- 经过调整的CRI-SPA能够对无色代谢物产生的全基因组分析.
- 提出了提高酵母细胞工厂中CCM生产的新策略.
- 了解宿主:通路相互作用对于优化代谢工程至关重要.


