通过深度学习辅助的介质设计和随后的养策略来培养高细胞密度的Corynebacterium glutamicum
1Department of Applied Chemistry, Kitami Institute of Technology, 165 Koen-cho, Kitami, Hokkaido 090-8507, Japan.
Journal of bioscience and bioengineering
|March 3, 2024
概括
使用贝叶斯优化 (BO) 和遗传算法 (GA) 的深度神经网络 (DNN) 通过优化媒体组件来提高Corynebacterium glutamicum生长率. 这使得食批量种植的细胞生产率和产量显著提高.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 微生物生理学 微生物生理学
- 代谢工程是代谢工程.
背景情况:
- 优化微生物生长对于工业生物技术至关重要.
- 科里尼细菌 (Corynebacterium glutamicum) 是一个重要的工业微生物.
- 提高细胞生产率需要精确控制介质成分.
研究的目的:
- 为了提高Corynebacterium glutamicum的初始特定生长率.
- 使用人工智能开发一个优化的媒介组成.
- 为了提高整个细胞生产率和发酵过程中的产量.
主要方法:
- 利用深度神经网络 (DNN) 模型与贝叶斯优化 (BO) 和基因算法 (GA) 集成用于媒介设计.
- 使用直角数组的实验设计来生成训练数据.
- 进行批量和养批量种植,以验证模型预测.
主要成果:
- 在预测增长率方面,DNN模型实现了高准确度 (R2test ≥ 0.98).
- 通过DNN-BO和DNN-GA识别的优化媒体组件,将特定增长率从0.242/h提高到0.355/h.
- 在优化葡萄糖和养的食批量培养中,细胞产量达到80g/L.
结论:
- 人工智能驱动的媒介优化显著提高了Corynebacterium glutamicum的生长.
- 和葡萄糖被确定为高密度种植的关键限制营养素.
- 开发的方法为微生物菌株和工艺开发提供了强大的工具.


