在Bipolaris maydis比赛O感染期间对抗性和易受性非CMS玉米基因型的比较转录组分析的调查
Shweta Meshram1, Robin Gogoi1, Bishnu Maya Bashyal1
1Division of Plant Pathology, New Delhi 110 012, India.
Heliyon
|March 4, 2024
概括
这项研究揭示了耐药玉米 (SC-7) 激活了强大的防御机制,包括氧化降低和信号,对抗梅氏叶病. 这些发现为开发抗病玉米品种提供了洞察力.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 玉米的育种 玉米的育种
背景情况:
- 梅迪斯叶病,由*Bipolaris maydis*引起,对玉米产量产生重大影响.
- 非CMS玉米对*B. maydis*种族O的分子防御机制尚未完全理解.
- 了解这些机制对于开发耐药玉米品种至关重要.
研究的目的:
- 对抗性玉米基因型 (SC-7) 和易受性品种 (CM 119) 的转录组进行比较分析,这些转录组是在感染 *B. maydis* 品种O. 的时候被感染的.
- 识别差异表达基因 (DEGs) 和阐明参与玉米防御反应的分子途径.
- 使用RT-qPCR验证RNA测序结果.
主要方法:
- 使用对抗性 (SC-7) 和敏感性 (CM 119) 玉米基因型的mRNA测序进行比较转录组概况.
- 用*B. maydis*比赛O进行注射,并在注射后48小时收集样本 (hPI).
- 对差异表达基因 (DEGs) 的分析和通过RT-qPCR的验证.
主要成果:
- 与对照组相比,在耐药 (1413) 和敏感 (2902) 基因型中发现了大量的DEG.
- 在接种的耐药和敏感基因型之间观察到总共10745个DEG.
- 耐药性基因型SC-7表现出强大的信号传导,特别是氧化减少和介导的通路,并调节了与健身相关的基因 (例如,阿尔多酶2,植物激素,P450细胞染色体).
结论:
- 抗性玉米基因型SC-7表现出一个强大的防御系统,涉及复杂的信号网络和有效调节健身基因.
- 在SC-7的转录性变化突出显示了许多与防御有关的基因的存在.
- 这些发现为了解玉米- *B. maydis* 相互作用提供了宝贵的信息,并可以为未来的作物改进计划提供疾病抵抗力的信息.
