机器学习确定与简单和基本类型的犬乳腺癌相关的茎状
Pedro L P Xavier1, Maycon Marção2, Renan L S Simões2
1Laboratory of Comparative and Translational Oncology (LOCT), Department of Veterinary Medicine, Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos, Universidade de São Paulo, Pirassununga, São Paulo, Brazil.
Heliyon
|March 5, 2024
概括
这项研究揭示了与简单癌症有关的犬乳腺瘤表现出较高的茎度,这与癌症的攻击性有关. 研究人员确定了这些侵袭性瘤的潜在治疗点POLA2和APEX1.
科学领域:
- 兽医瘤学 兽医瘤学
- 癌症干细胞生物学
- 狗乳腺瘤 (CMTs) 是一种疾病.
背景情况:
- 简单瘤是具有恶性恶性犬乳腺瘤 (CMTs),预后不佳的攻击性瘤.
- 癌症干性有助于瘤发病,恶性瘤和治疗耐药性,但其在CMT亚型中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 验证一种机器学习算法,用于预测犬类癌细胞的干细胞.
- 为了研究不同犬类乳腺瘤亚型的茎度水平.
- 确定与CMT中的茎性相关的潜在治疗点.
主要方法:
- 验证了一种犬类一类逻辑回归 (OCLR) 算法,用于预测CMT样本中的茎度 (mRNAsi).
- 分析了与组织学亚型,基底状特征和NMF2元基因特征相关的干度水平.
- 进行了相关性分析,以确定与高和低茎度相关的基因,随后进行了基因组丰富分析.
主要成果:
- 与复杂的癌症和其他CMT亚型相比,简单的癌症表现出明显更高的茎度 (mRNAsi).
- 升高的茎度与基底类CMT和NMF2DNA修复元基因特征有关.
- 确定了POLA2和APEX1作为有前途的干度相关点,特别是在简单癌症中.
结论:
- 干细胞是导致犬乳腺瘤的攻击性和发展的关键因素,特别是简单的癌症.
- 向茎状途径为犬乳腺瘤提供了一个有前途的治疗策略.
- POLA2和APEX1是管理攻击性CMT的潜在治疗点.
