在不同的地理尺度上出现和传播Mycobacterium ulcerans

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 进化生物学是进化的生物学.
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 杆菌 (Mycobacterium ulcerans) 引起布鲁利,这是一个在非洲和澳大利亚普遍存在的严重皮肤感染.
• 经典的M. ulcerans血统是人类Buruli病例的主要原因.
• 环境水库与M. ulcerans的传播密切相关.

研究的目的:

• 定义M. ulcerans古典血统的进化历史和种群动态.
• 在全球和地方范围内调查M. ulcerans的植物地理和传播模式.
• 通过比较基因组分析了解M. ulcerans的传播动态.

主要方法:

• 分析了来自两个大陆的13个国家的1,045个M. ulcerans分离物.
• 基因组和进化方法的应用.
• 植物地理和人口动态建模.

主要成果:

• 在7000多年前,M. ulcerans的血统从澳大利亚传播到非洲,在18世纪和19世纪爆发了疫情.
• 过去一个世纪的全球传播与当前主要是本地传播链形成鲜明对比.
• 贝宁特有地区的基因型是最近引入的,并不是随机分布的.
• 全球范围内存在着不同的,分隔的特有菌,特别是在非洲和澳大利亚.

结论:

• 对比基因组分析提供了对M. ulcerans传播的关键见解.
• 了解植物地理和人口动态是管理布鲁利的关键.
• 最近的引入和局部传播模式在特有地区显而易见.