一个殖民亚斯基的基因组资源和注释,光球海 Clavelina lepadiformisis

科学领域:

• 发育生物学是发展生物学.
• 进化生物学是进化的生物学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 阿西迪亚人是脊椎动物的姊妹群体,这使得他们对了解脊椎动物起源至关重要.
• 大多数阿西迪亚的发育研究都集中在Phlebobranchia和Stolidobranchia上,使得Aplousobranchia的代表性不足.
• 了解aplousobranchian发展是推断祖先的ascidian发展计划的关键.

研究的目的:

• 为了为阿普洛索布兰克 Clavelina lepadiformis 生成基因组资源.
• 为了使分子胚胎学研究在Aplousobranchia顺序.
• 为了促进对阿斯基迪亚体内发育基因调节网络的比较研究.

主要方法:

• 在各种胚胎阶段进行转录组测序.
• 基因组组装和注释. 基因组组装和注释.
• 基因含量和质量的生物信息分析 (BUSCO).

主要成果:

• 为Clavelina lepadiformis制作了一个转录组和注释基因组组合.
• 基因组组合包括184个结合体 (233.6 Mb) 与高N50 (8.5 Mb).
• 确定了32318个预测基因,捕获了96.3%的BUSCO正义基因,表明了高质量.

结论:

• 生成的基因组资源适合研究虫的发育基因表达和调节.
• 这些资源将有助于在类动物中推进比较胚胎学.
• 这些数据还将支持关于虫和脊椎动物起源的进化和生态研究.