基于高密度 bin 的基因地图揭示了来自野生花生的530kb染色体段,有助于晚叶斑抗性

科学领域:

• * 植物遗传学和育种
• * 农作物病理学 农作物病理学
• * 基因组学 是一个学科.

背景情况:

• * 晚叶斑 (LLS) 是一个主要的花生疾病,导致大量的产量和质量损失.
• * 野生阿拉基斯物种具有优越的LLS耐药性,但交叉繁殖的繁殖挑战限制了它们的使用.
• * 弥合野生花生和栽培花生之间的差距对于提高作物弹性至关重要.

研究的目的:

• * 为了确定在花生中对晚叶斑 (LLS) 产生抵抗力的遗传位点.
• * 探索野生花生生殖质对LLS耐药性的贡献.
• *发现候选基因和基因组区域,用于LLS耐药花生的标记辅助育种.

主要方法:

• *从具有高LLS耐药性的野生花生物种中制造合成两倍体 (Ipadur).
• * 通过将Ipadur与种植花生 (Tifrunner) 交叉来开发一个重组的近亲 (RIL) 种群.
• *对200个RIL进行全基因组再测序,以构建高密度遗传图,并确定定量特征位点 (QTL).
• *在多种环境中对LLS耐药性的表型评估.

主要成果:

• * 构建了一个高密度的遗传地图,其中有4,809个 bin标记.
• * 确定了对LLS耐药性的28个QTL,解释了显著的表型变异 (4.35-20.42%).
• * 在染色体14上始终检测到一个主要的QTL,qLLS14.1.
• * qLLS14.1区域的野生祖先 (Ipadur) 的530kb段与LLS耐药性有关,其中含有23种具有序列变化的抗病蛋白.

结论:

• *来自野生花生物种的530kb基因组段对LLS耐药性有显著的贡献.
• *已识别的QTL和候选基因为培育耐LLS的花生品种提供了宝贵的资源.
• *将这些阻力位点定位为金字塔,可以在种植的花生中产生持久的LLS耐药性.