通过高通量测序,对帕拉克瓦特诱导的肺上皮质-介质细胞过渡中ceRNA-miRNA变化的综合分析
Zhiyu Ma1, Nana Wang2, Tingting Meng1
1Department of Emergency Medicine, Shengjing Hospital of China Medical University, Shengyang, China.
Journal of biochemical and molecular toxicology
|March 6, 2024
概括
帕拉克瓦特 (PQ) 中毒会通过表皮细胞-介质细胞转变 (EMT) 导致致命的肺纤维化. 这项研究确定了参与PQ诱导的EMT的新型分子标和网络,为肺纤维化新疗法提供了希望.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 皮质-介质细胞过渡 (EMT) 与帕奎特 (PQ) 诱导的组织纤维化有关,这是PQ中毒死亡的主要原因.
- 目前,没有有效的治疗方法可以治疗由PQ中毒引起的肺间歇性纤维化.
研究的目的:
- 通过生物信息学分析,确定PQ诱导的EMT和肺纤维化新型治疗点.
- 探索PQ诱导的EMT背后的分子机制和调节网络.
主要方法:
- 对暴露于PQ的小鼠进行了转录组测序,分析了信使RNA (mRNA),长非编码RNA (lncRNA),微RNA (miRNA) 和圆形RNA.
- 进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析.
- 建立了lncRNA-miRNA-mRNA调节网络,以识别关键分子参与者.
主要成果:
- PQ诱导的EMT涉及与信号传导,癌症,内分泌和免疫系统相关的途径.
- 上调的基因包括Il22ra2, Mdm4, Slc35e2和Angptl4;下调的基因包括RGS2, Gabpb2, Acvr1, Prkd3, Sp100, Tlr12, Syt15和Camk2d.
- 针对PQ诱导的肺纤维化,确定了13个潜在的竞争性内源性RNA (ceRNA) 标.
结论:
- 这项研究阐明了对PQ诱导的EMT至关重要的分子通路和网络.
- 已确定的分子标和ceRNA网络为开发针对PQ诱导的肺纤维化新型治疗策略提供了基础.
