堆肥减少了在转录水平上肉牛便中抗体的风险

科学领域:

• 环境微生物学 环境微生物学
• 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
• 畜牧业废物管理 畜牧业废物管理

背景情况:

• 肥料处理对于减轻抗生素耐药性的环境传播至关重要.
• 堆肥和储存是常见的便处理方法,其有效性受到争议.
• 转录组分析为活跃的微生物群落和基因表达提供了更深入的见解.

研究的目的:

• 为了比较堆肥和传统储存,以减少牛肉肥中的抗生素耐药基因 (ARG) 风险.
• 评估每个方法在DNA和转录层面的有效性.
• 为了确定高风险的ARG及其在经过处理的肥中的潜在宿主.

主要方法:

• 从堆肥和储存堆中的便样本进行元基因组和元转录组分析.
• 在DNA和RNA水平上对抗体配置的比较.
• 鉴定ARG宿主,包括动物传染病原体,如大肠杆菌和肺炎Klebsiella.

主要成果:

• 在堆肥和储存之间在DNA层面上没有观察到抗体的显著差异.
• 在转录基层上,堆肥证明了ARG,ARG亚型和高风险移动ARG的优异减少.
• 与表面相比,在堆肥堆的中心发生了更高的ARG和ARG转录去除,尽管温度很高.

结论:

• 堆肥比储存更有效地减少了牛中的活跃微生物群体中ARG的风险.
• 转录组分析对于准确评估降低ARG风险至关重要.
• 堆肥提供了一个显著的优势,以减轻来自牲畜便的抗生素耐药性的环境传播.