全基因组识别,DNA甲基转移酶的演变及其在Larimichthys crocea盐度压力下的表达
Yu Zhang1, Jiaqian Chen1, Baoxiao Zheng2
1School of Fishery, Zhejiang Ocean University, Zhoushan, Zhejiang 316022, China.
International journal of biological macromolecules
|March 6, 2024
概括
七个DNA甲基转移酶 (Dnmts) 在大型黄色croaker.中被确定. 两个特定的基因,LcDnmt1和LcDnmt3a2,对于对盐度压力的反应至关重要,突出了它们在表观遗传调节中的作用.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- DNA甲基转移酶 (Dnmts) 通过DNA甲基化调节基因表达和环境反应.
- 了解Dnmt基因家族对于理解水生生物的表观遗传适应至关重要.
研究的目的:
- 为了识别和描述大黄鱼 (Larimichthys crocea) 中的DNA甲基转移酶 (Dnmt) 基因.
- 为了研究这些基因在应对盐度压力的作用.
- 为了探索Dnmt家族在teleosts中的进化保存.
主要方法:
- 对LcDnmt基因的全基因组识别.
- 对基因结构,蛋白质域和亚细胞局部化的分析.
- 遗传学分析以确定进化关系.
- 在盐度应激下使用RNA-seq,qRT-PCR和西部斑点进行基因表达分析.
主要成果:
- 鉴定了7个LcDnmt基因,并将它们分为Dnmt1,Dnmt2和Dnmt3组.
- 遗传学分析表明,Dnmt家族在teleosts中的保存率很高.
- LcDnmt1和LcDnmt3a2在盐度压力下显示出显著的调节,具有明显的组织表达模式 (肝脏,肠道,大脑).
结论:
- Dnmt基因家族在远程进化过程中一直存在.
- LcDnmt1和LcDnmt3a2是大黄鱼对盐度压力的表观遗传反应中的潜在关键参与者.
- 这些发现为未来关于鱼类表观遗传调节的功能研究提供了基础.
