地下水病毒的高利基特异性和宿主遗传多样性
Emilie Gios1,2, Olivia E Mosley1,3, Michael Hoggard1
1School of Biological Sciences, The University of Auckland, Auckland 1010, New Zealand.
The ISME journal
|March 7, 2024
概括
地下水病毒是多种多样的,并且在很大程度上未被分类,许多病毒可能会影响微生物代谢和生物地化学循环. 这项研究揭示了新的病毒基因组及其在地球地下预测的作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 环境科学 环境科学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 含水层拥有多样化的微生物,但这些地下水生态系统中的病毒仍然不太了解.
- 病毒显著影响微生物社区结构,新陈代谢和生态系统功能.
- 了解地下水病毒对于理解地下生物地球化学循环至关重要.
研究的目的:
- 描述各种地下水环境中的病毒多样性和潜在功能.
- 识别病毒宿主及其在微生物新陈代谢和生物地化学过程中的作用.
- 探索病毒对微生物社区分布和地下功能的影响.
主要方法:
- 来自各种地下水物理化学学的16个元基因组的分析.
- 病毒基因组的恢复和聚类成高质量的病毒操作分类单元.
- 病毒宿主和辅助代谢基因的in silico预测.
主要成果:
- 恢复了1571个病毒基因组,属于468个高质量的病毒操作分类单元,其中95%未分类.
- 至少有15%的病毒是转录活跃的,这表明尽管资源有限,但在微生物过程中发挥了作用.
- 预测的病毒宿主包括与碳,和硫循环相关的超小核细胞,确定了205个辅助代谢基因.
结论:
- 地下水病毒群体在很大程度上尚未被探索,与其他含水层相比,它们呈现出独特的多样性.
- 病毒可能在操纵微生物群落和影响地表地下生物地化学循环方面发挥着重要作用.
- 病毒和 prokaryotic 分布与地下水参数相关,表明宿主控制和环境影响.
