基于批量和单细胞RNA测序数据的结直肠癌与烧灭相关的预后模型的识别和验证
Li-Hua Zhu1, Jun Yang1, Yun-Fei Zhang1
1Department of Surgical Oncology, The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming 650032, Yunnan Province, China.
World journal of clinical oncology
|March 8, 2024
概括
这项研究开发了一种8基因的热模型,以预测结直肠癌 (CRC) 的存活率. 该模型有效地与免疫透相关,为CRC预后提供了一个新的工具.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 作为一个被编程的细胞死亡途径的灭,在恶性瘤的发展中起着复杂的作用.
- 在结肠直肠癌 (CRC) 中,与热致死相关的基因的预后意义仍然不清楚.
- 了解这些基因的影响对于改善CRC患者的治疗结果至关重要.
研究的目的:
- 为了确定与结直肠癌的预后价值的关键 pyroptosis 相关基因.
- 开发基于这些基因的CRC生存预测模型.
- 为了研究火灭菌模型与瘤免疫透之间的关联.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 和GEO数据集进行基因表达分析.
- 开发了一种使用LASSO回归的预后模型,其中有8个已识别的与火死相关的基因.
- 通过生存分析评估模型准确性,并使用CIBERSORTx.使用免疫透与它相关联.
主要成果:
- 一个8基因的热灭风险模型 (包括CHMP2B,SDHB,BST2,UBE2D2,GJA1,AIM2,PDCD6IP,SEZ6L2) 已成功构建 (P<0.05).
- 七个基因显示CRC和正常组织之间的差异性表达 (P <0.05).
- 较高的风险得分与增加的死亡率和减少的存活率相关 (P <0.05),风险组之间的免疫透率有显著差异.
结论:
- 为结直肠癌建立了一种新的与烧灭相关的预后模型.
- 该模型显示了与瘤免疫透模式的显著相关性.
- 这种预测工具具有提高结直肠癌预后评估的潜力.
