为单细胞RNA-seq应用解剖和分离小鼠脑干的协议
Wiktor S Phillips1, Naify Ramadan1, Athina Samara2
1Department of Women's and Children's Health, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden; Astrid Lindgren Children's Hospital, Karolinska University Hospital, Stockholm, Sweden.
STAR protocols
|March 10, 2024
概括
这项研究提出了一个新的协议,用于处理新生儿小鼠脑干组织的转录学. 该方法使异步样本采集和细胞处理成为可能,克服了来自小大脑结构的低细胞产量的挑战.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 对小脑结构的转录分析,如脑干核,受到低细胞产量的阻碍.
- 需要有效的协议来剖析,分离和保存这些微妙的组织.
研究的目的:
- 开发和验证一种用于处理新生小鼠脑干组织用于单细胞转录的协议.
- 为了实现异步采样和下游处理,提高细胞产量和实验灵活性.
主要方法:
- 建立了一个切割,解离和冷保存新生小鼠脑干组织的协议.
- 该方法使用preBötzinger复合物和SmartSeq3cDNA库准备方法进行了演示.
主要成果:
- 该协议成功地从小的大脑干结构中产生可行的细胞.
- 它允许灵活,异步的样本采集和处理,解决以前的局限性.
结论:
- 这种冷保存和解离协议对新生小鼠脑干组织有效.
- 该方法可以适应各种脑干区域和转录组图书馆准备技术.
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