人类大脑中的C9orf72基因网络与C9-FTD中的皮质厚度相关,并涉及易受伤害的细胞类型
Iris J Broce1,2, Daniel W Sirkis1, Ryan M Nillo3
1Memory and Aging Center, Department of Neurology, Weill Institute for Neurosciences, University of California San Francisco, San Francisco, CA, United States.
Frontiers in neuroscience
|March 12, 2024
概括
最常见的ALS和FTD遗传原因C9orf72具有2,120个共同表达基因的网络. 这个网络揭示了神经退行性疾病中特定细胞类型的脆弱性.
科学领域:
- 神经遗传学 神经遗传学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
- 神经退行性疾病 神经退行性疾病
背景情况:
- 在C9orf72中,六核酸重复扩张 (HRE) 是肌缩侧面硬化症 (ALS) 和前性痴呆症 (FTD) 的主要遗传原因.
- 了解具有与C9orf72相似的表达模式的基因对于识别新型治疗点和阐明ALS/FTD病变发生过程中选择性脆弱性的机制至关重要.
研究的目的:
- 在健康的人类大脑中识别与C9orf72共同表达的基因.
- 研究C9orf72-HRE载体中C9orf72共同表达基因和皮质厚度模式之间的相关性.
- 探索已识别的C9orf72共同表达网络的细胞和分子丰富.
主要方法:
- 利用来自艾伦人类大脑图谱的mRNA表达数据,分析了51个大脑区域的C9orf72联合表达模式.
- 进行了C9orf72表达和15633个蛋白质编码基因之间的相关性分析,包括已知的ALS/FTD相关基因.
- 在C9orf72-HRE载体和对照中进行了成像转录组分析,将基因表达与皮质厚度相关联.
主要成果:
- 在C9orf72-HRE载体中鉴定了2,120个基因,这些基因表现出类似于C9orf72的解剖表达模式,并且与皮质厚度相关.
- C9orf72成像转录组网络显示了与ALS/FTD相关的细胞群体的差异表达,例如5b层细胞和条状神经元.
- 丰富分析揭示了与包括蛋白质无化,自和DNA损伤反应在内的途径的显著关联.
结论:
- 已经确定了2120个与C9orf72相关的基因网络,可能会影响ALS和FTD的区域和细胞类型特定漏洞.
- 这个网络提供了对C9orf72相关疾病中选择性神经退行症的分子基础的见解.
