RISMiCal:一个软件包,可以快速执行RISM/3D-RISM计算
Yutaka Maruyama1,2, Norio Yoshida3
1Data Science Center for Creative Design and Manufacturing, The Institute of Statistical Mathematics, Tachikawa, Tokyo, Japan.
Journal of computational chemistry
|March 12, 2024
概括
RISMiCal包提供了使用参考交互站点模型 (RISM) 和其3D扩展的溶解效应的快速计算建模. 这种工具加速了溶液中化学和生物过程的研究.
科学领域:
- 计算化学是一种计算化学.
- 物理化学 物理化学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 溶剂效应在化学,物理和生物过程中至关重要.
- 参考交互站点模型 (RISM) 和3D-RISM是研究解法的关键计算方法.
- 现有的RISM/3D-RISM计算可能是计算密集的.
研究的目的:
- 推出RISMiCal,这是RISM和3D-RISM的集成计算包.
- 为现有计算化学软件提供一个用户友好的界面.
- 为了加快分析各种科学领域的溶解效应.
主要方法:
- 在RISM和3D-RISM理论的基础上开发RISMiCal.
- 使用CUDA实现快速的GPU (图形处理单元) 代码.
- 与Gaussian16,GAMESS和Tinker等外部程序进行集成.
主要成果:
- RISMiCal为RISM和3D-RISM计算提供了一个统一的平台.
- 该软件包包含高效的单个和多个GPU实现,用于加速计算.
- 与流行的计算化学软件的接口提高了可用性.
结论:
- RISMiCal显著提高了RISM/3D-RISM方法的可访问性和应用.
- 预计该包将在研究溶液中的化学和生物过程中找到广泛的应用.
- 该软件是科学界公开使用的.


