水友互动液态染色学-/交换质谱 (HILIC-HDX-MS) 用于非目标代谢学
Tomas Cajka1, Jiri Hricko1, Stanislava Rakusanova1
1Institute of Physiology of the Czech Academy of Sciences, Videnska 1083, 14200 Prague, Czech Republic.
这项研究探讨了水友互动液体色谱与/交换质谱学 (HILIC-HDX-MS) 结合,以改善在非目标代谢学中的代谢物识别. 该方法成功地在生物样本中识别了未知的化合物N1-乙精氨酸.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生物化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 使用液态色谱与质谱学 (LC-MS) 的非向代谢学识别了数千个分子特征,但代谢物注释率较低,高达90%的信号未被识别.
- 目前改善注释的方法包括串联质谱库和in silico碎片软件,但这些都有局限性.
- /交换质谱 (HDX-MS) 提供了一个额外的结构信息层,可以帮助识别未知的代谢物.
研究的目的:
- 调查水友交互液态色谱 (HILIC) -HDX-MS在非目标代谢学中增强代谢物注释的潜力.
- 评估两个不同的HILIC-HDX-MS方法:柱后的氧化 (D2O) 添加和柱上的方法.
- 通过在各种生物矩阵中识别未知的化合物来证明HILIC-HDX-MS的实际应用.
主要方法:
- 评估两种HILIC-HDX-MS技术:后列D2O添加和列上的HILIC-HDX-MS.
- 应用HILIC-HDX-MS方法来分析血,血清,组织和便中的未知化合物.
- 使用MS-FINDER软件对检测到的未知特征进行in silico碎片分析.
主要成果:
- 该研究评估了后列和列上的HILIC-HDX-MS方法对代谢物识别的有效性.
- 与MS-FINDER相结合的HILIC-HDX-MS方法成功地确定了多种生物样本类型中存在的未知代谢物.
- 确定的化合物被确认为N1-乙精氨酸,证明了开发的方法的实用性.
结论:
- 在非目标代谢学中,HILIC-HDX-MS为增加代谢物注释率提供了一个有希望的策略.
- 开发的方法,包括in silico碎片化,对于在复杂的生物样本中识别以前未知的代谢物是有效的.
- 这种方法可以大大有助于更深入地了解代谢概况和途径.
更多相关视频
11:32A Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry HDX-MS Platform for Investigating Peptide Biosynthetic Enzymes
Published on: May 4, 2020
05:45Capillary Electrophoresis-based Hydrogen/Deuterium Exchange for Conformational Characterization of Proteins with Top-down Mass Spectrometry
Published on: June 8, 2021
相关概念视频
Mass Spectrometry: Complex Analysis
GC–MS is a powerful hyphenated method commonly used in forensics and environmental...
High-Resolution Mass Spectrometry (HRMS)
High-Performance Liquid Chromatography: Types of Detectors
Peptide Identification Using Tandem Mass Spectrometry
This technique helps gather information regarding the protein from which the peptide was obtained and to study the peptides’ amino acid sequence. Identifying peptides from a complex mixture is an important component of the growing field of...
