在Mycobacterium tuberculosis感染下识别和验证与巨分极化和细胞死亡模式相关的基因
Zisha Yang1,2, Jiajun Wang1,2, Jiang Pi1,2,3
1Guangdong Provincial Key Laboratory of Medical Molecular Diagnostics, The First Dongguan Affiliated Hospital, Guangdong Medical University, Dongguan, Guangdong, 523713, People's Republic of China.
Journal of inflammation research
|March 13, 2024
概括
结核菌菌的感染会在M1和M2巨细胞中触发不同的细胞死亡模式. M1巨细胞表现出高度的亡,自,铁和热,可能会影响疾病的进展和免疫规避.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 巨细胞在对Mycobacterium tuberculosis (Mtb) 的免疫反应中发挥着至关重要的作用.
- M1和M2巨体代表着不同的功能表型,在宿主防御和疾病发病过程中发挥着不同的作用.
- 了解巨细胞的反应,包括细胞死亡机制,对于开发有效的结核病 (TB) 治疗至关重要.
研究的目的:
- 调查M1/M2巨分极和Mycobacterium结核病 (Mtb) 感染期间各种细胞死亡模式之间的相关性.
- 识别与这些过程相关的关键基因,用于潜在的诊断应用.
主要方法:
- 利用了基因表达总量 (GEO) 数据库中的基因表达特征的生物信息学分析.
- 来自KEGG,FerrDb和GSEA数据库的综合数据,用于与细胞死亡相关的基因.
- 使用R包 (limma,VennDiagram) 进行差异基因表达和交叉分析.
- 构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行了接收器操作特征 (ROC) 曲线分析,以确定枢纽基因.
- 通过Western Blot和定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 验证了关键基因表达.
主要成果:
- 鉴定了与M1和M2巨细胞相关的不同集的枢纽基因,这些巨细胞经历了Mtb感染和细胞死亡.
- 与M2巨相比,M1巨显示出与亡,自亡,铁亡和热亡相关的基因的显著更高的表达.
- 特定的基因如NFKB1,TNF,CFLAR,TBK1,IL6,RELA,AIM2,BIRC3和DEPTOR表现出不同的表达模式.
结论:
- 某些基因 (NFKB1,TNF,CFLAR,TBK1,IL6,RELA,M1中的AIM2;M2中的TNF,BIRC3,DEPTOR) 可能作为结核病的潜在诊断生物标志物.
- 在Mtb感染早期的M1巨中细胞死亡的增加可能会导致M1巨过渡到M2.
- 这种过渡可能代表了Mtb用于免疫逃避的机制.
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