单细胞转录组测序识别了皮下患者衍生的异种移植复合的髓母细胞瘤

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 翻译研究是翻译研究.

背景情况:

• 脑髓母细胞瘤 (MB) 是一种流行的儿科脑癌.
• 研究MB瘤发生需要准确的临床前模型.
• 在不同的MB模型中比较单细胞复述是至关重要的.

研究的目的:

• 为了比较皮下患者衍生异体移植 (sPDX),内患者衍生异体移植 (iPDX) 和基因工程小鼠模型 (GEMM) 进行髓母细胞瘤 (MB) 复制.
• 在单细胞水平上分析基因表达,细胞组成和通路丰富.
• 为特定研究目标选择合适的MB模型提供指导.

主要方法:

• 从人类声波刺 (SHH) 和组3 (G3) MB样本开发sPDX和iPDX模型.
• 包含用于比较分析的Patch+/-GEMM模型.
• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 用于转录和细胞分析.
• 大量RNA-seq解卷用于跨模型细胞组成比较.

主要成果:

• 对于SHH和G3亚组,sPDX模型在单细胞水平上表现出与人类初级MB瘤的最高转录组相关性.
• GEMM模型成功地重复了在人类SHH瘤中发现的所有瘤微环境 (TME) 细胞亚群.
• 与人类SHH瘤相比,GEMM模型显示了瘤相关的天体细胞和免疫细胞的比例更高,以及额外的血管内皮团.

结论:

• 这项研究提供了实验MB模型的第一次单细胞水平比较.
• sPDX和iPDX模型适用于药物测试和个性化治疗查.
• 在TME中研究瘤细胞相互作用时,GEMM模型非常有价值.