在小鼠的芽细胞形成过程中,ADNP调节SINE B2衍生CTCF结合位
Wen Wang1,2, Rui Gao1, Dongxu Yang1,2
1Clinical and Translational Research Center of Shanghai First Maternity and Infant Hospital, Shanghai Key Laboratory of Signaling and Disease Research, Frontier Science Center for Stem Cell Research, School of Life Sciences and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China.
Genes & development
|March 13, 2024
概括
对于早期发展,CTCF的绑定是必不可少的. 这项研究揭示了ADNP在特定DNA位点调节CTCF,影响小鼠胚胎中的基因表达和细胞分化.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 在胚胎早期发育过程中,CTCF蛋白对染色质组织和基因调节至关重要.
- 在植入前胚胎中CTCF结合的精确时间和动态尚不清楚.
研究的目的:
- 在小鼠植入前发育过程中调查CTCF染色质占用动力学.
- 确定特定的CTCF结合位点及其由其他蛋白调节.
主要方法:
- 使用CUT&RUN技术绘制了CTCF的占用情况.
- 分析CTCF结合点,包括与可转移元素相关的结合点.
- 通过淘汰赛实验研究了ADNP的作用.
主要成果:
- 在囊胚基因组激活 (ZGA) 之前,CTCF 结合基因组,有利于染色质循环.
- 一个CTCF站点的子集,富含B2 SINE元素,是阶段特定的裂变阶段.
- ADNP 蛋白质限制了在 SINE B2 位点的 CTCF 结合;Adnp 淘汰会影响 CTCF 恢复,H3K9me3 沉积,并导致 SINE B2 脱压和分化缺陷.
结论:
- 对CTCF结合的ADNP依赖性调节对于控制哺乳动物早期发育过程中的可转移元素活性至关重要.
- 这种规则确保了植入前胚胎的适当细胞分化和基因组完整性.
- 可转移的元素在塑造哺乳动物特有的早期发育中发挥着积极的作用.
