集成的转录基因组和蛋白质组分析β-甘氨酸诱导的小猪肠道损伤

科学领域:

• 动物科学动物科学
• 分子生物学分子生物学
• 胃肠病学 胃肠病学

背景情况:

• 已知β-conglycinin (β-CG) 在小猪中诱导肠道损伤.
• 这种损伤背后的精确分子机制尚未完全阐明.

研究的目的:

• 调查小猪中β-CG诱导的肠损伤的分子机制.
• 为了识别下游基因和蛋白质,由β-CG在阴中调节.

主要方法:

• 用β-CG.治疗的小猪的阴茎组织的转录和蛋白质组分析.
• 使用qRT-PCR和西式涂抹对差异表达基因 (DEGs) 和蛋白质 (DEPs) 的验证.
• 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
• 构建一个蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络.

主要成果:

• β-CG显著降低了小猪的高度,并在小猪中增加了密室深度.
• 确定了382个DEG和292个DEP,转录基因和蛋白质基因数据之间的相关性得到了验证.
• 富化分析表明与氧化相关的转基因生物和与溶酶体相关的途径的参与.
• 六个基因在转录和蛋白质水平上都显示出显著的差异性表达.

结论:

• 通过基因和蛋白质表达的改变,β-CG在小猪中诱导肠道损伤.
• 氧化和溶酶体相关途径与β-CG诱导的肠损伤的分子机制有关.
• 综合转录组和蛋白组分析提供了对β-CG对小猪内的影响的全面了解.