使用高通量标记器识别 Sorghum 生物能源协会面板内的调解结构性和非结构性碳水化合物积累的 pleiotropic 位点

科学领域:

• 植物遗传学和育种.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物能源作物改善作物

背景情况:

• 改善[Sorghum bicolor (L.) Moench]用于生物能源需要了解控制生物质和碳分区的遗传因素.
• 基因组辅助育种依赖于识别新的标记特征关联和候选基因.

研究的目的:

• 为了进行生物能源特征改进,对多种种子质进行分子表征.
• 为了确定与生物质和的组成特征相关的遗传位置和候选基因.

主要方法:

• 来自生物能源协会小组 (BAP) 的365个加入的全基因组测序 (WGS).
• 处理了高密度基因组标记数据,包括单核酸多态 (SNP) 和插入删除 (indels).
• 针对包括植物高度,生物质和成分在内的表型特征进行了全基因组关联研究 (GWAS).

主要成果:

• 鉴定了的生物能源相关特征的新型基因位置和候选基因.
• 验证了已知的植物高度 (Dw1, Dw2) 和种子颜色 (Y1) 的基因.
• 使用多变量适应收缩分析发现了生物能源和组成特征的共享标记特征关联.

结论:

• 新的标记特征关联和类QTL被确定用于改善的生物能量.
• 开发的基因组资源和确定的协会可以促进标记器辅助育种,以提高生物质和组成.
• 生物能源小组为未来的遗传研究和混合开发提供了机会.