基因细胞对Trichophyton mentagrophyte感染的反应基于整个转录组分析
Fangfang Zang1, Zhangxu Wang1, Yuanxue Yang1
1Basic Medicine Research Innovation Center for cardiometabolic diseases, Ministry of Education, School of Pharmacy, Model Animal and Human Disease Research of Luzhou Key Laboratory, Laboratory Animal Center, School of Basic Medical Sciences, School of Stomatology, School of Clinical Medicine, Southwest Medical University, Luzhou, China.
Mycoses
|March 14, 2024
概括
感染Trichophyton mentagrophytes会损害质细胞,并引发基因表达的显著变化,包括循环RNA,lncRNA,mRNA和miRNA. 这项研究揭示了参与皮肤免疫和真菌反应的分子途径,为皮肤植物病提供了潜在的治疗点.
科学领域:
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 皮肤病学 皮肤病学
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 皮肤植物病是一种常见的真菌感染,影响人类和动物,Trichophyton mentagrophytes是主要原因.
- 角质细胞对皮肤免疫力和对T. mentagrophytes的防御至关重要,但它们在转录基因水平上的反应在很大程度上尚未研究.
研究的目的:
- 使用全转录组测序系统地分析感染T. mentagrophytes的角质细胞中的分子变化.
- 识别差异表达的RNA并构建竞争的内源RNA (ceRNA) 网络.
主要方法:
- 用T. mentagrophytes感染状细胞,并通过显微镜和TUNEL测定观察表型变化.
- 全转录组测序 (RNA-seq,小RNA-seq) 和生物信息学分析.
- 使用qRT-PCR验证RNA表达和ceRNA网络可靠性.
主要成果:
- T. mentagrophytes感染诱导了角质细胞的形态变化,膜损伤,亡以及循环RNA,lncRNA,mRNA和miRNA表达的显著改变.
- 对circRNA-miRNA-mRNA和lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的构建揭示了涉及真菌识别,炎症,天生的免疫力和角质细胞死亡的相互作用.
- 功能性丰富分析突出了已识别的RNA在细胞反应,免疫启动和皮肤屏障建立中的作用.
结论:
- 这项研究提供了全面的洞察力,了解状细胞对T. mentagrophytes感染的反应.
- 已确定的分子通路和调节网络为治疗皮肤植物病提供了潜在的新型治疗点.
