在厄瓜多尔极度危的Atelopus和水生息地中实地分子检测Batrachochytrium dendrobatidis

科学领域:

• 两动物疾病生态学
• 分子诊断学 分子诊断学
• 保护遗传学 保护遗传学

背景情况:

• 巴特拉科希特 (Batrachochytrium dendrobatidis,Bd) 对全球两动物种群构成重大威胁.
• 快速和敏感的检测方法对于管理Bd.至关重要.
• 现场部署的基于DNA的技术是需要在偏远地区的监测.

研究的目的:

• 评估基于现场的DNA提取和便携式PCR用于检测Bd.的有效性.
• 评估厄瓜多尔临灭绝的阿特洛普斯及其水生息地中的Bd存在.
• 将实地实验室的eDNA结果与标准实验室发现进行比较.

主要方法:

• 收集了来自Atelopus balios,A. nanay和A. bomolochos的皮肤拭子.
• 从河流中收集环境DNA (eDNA) 样本.
• 利用一个可装配的实地实验室和便携式PCR进行DNA分析.
• 基于现场的eDNA处理与传统的大学实验室方法进行了比较.

主要成果:

• 在12个水样中的6个和12个两动物样本中的10个中检测到Bd.
• 基于现场的eDNA结果与基于实验室的结果有很高的一致性.
• 便携式PCR装置在现场检测Bd时证明有效.

结论:

• 基于现场DNA的监测是检测两动物种群和息地的Bd的可行策略.
• 这种方法对于偏远地区的保护特别有价值.
• 这些发现支持厄瓜多尔的两动物保护国家行动计划和全球Bd控制努力.