在SARS-CoV-2感染子群体中的代谢表型的交叉验证使用向液体染色学-质谱学 (LC-MS)
Luke Whiley1,2, Nathan G Lawler1,2, Annie Xu Zeng1
1Australian National Phenome Centre, Health Futures Institute Harry Perkins Institute, Murdoch University, 5 Robin Warren Drive, Perth, WA 6150, Australia.
Journal of proteome research
|March 14, 2024
概括
向液体染色体质谱法 (LC-MS) 试验有效验证了SARS-CoV-2感染的代谢表型. 这种方法通过在独立样本组中分析有机酸和胆酸来证实生物有效性.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 传染病研究 传染病研究
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 代谢表型化中的生物有效性需要在独立样本集中进行复制.
- 有针对性的工作流程,特别是液态染色体质谱 (LC-MS),为验证提供了强大的定量能力.
研究的目的:
- 评估针对有机酸和胆酸的向LC-MS试验在验证SARS-CoV-2感染的代谢表型方面的能力.
- 在两个独立的样本集中评估代谢发现的可重现性.
主要方法:
- 来自SARS-CoV-2阳性个体和健康对照组的血和血清样本的分析在两个独立的队列 (澳大利亚和西班牙) 中进行.
- 利用了针对性的LC-MS测定,重点关注有机酸和胆酸.
- 使用多变量 (OPLS-DA) 和单变量统计分析来解释数据.
主要成果:
- 卧底结构差异分析 (OPLS-DA) 的直角预测成功地分类了来自两个队列中的SARS-CoV-2阳性个体的健康对照 (ROC-AUC = 1).
- 在不同组中确定了23种显著不同的代谢物 (p < 0.05).
- 观察到细胞能量代谢,氧化应激,缺氧,肝脏活动和宿主肠道微生物代谢的持续性干扰.
结论:
- 有针对性的LC-MS代谢表型化工作流程适用于SARS-CoV-2感染表型的生物验证.
- 这项研究支持使用这些向测试在独立样本集中进行可靠和可重复的代谢分析.
