在柏林脂肪鼠标BFMI861线路中使用时间序列数据识别额外的体重QTL

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 代谢综合征研究 代谢综合征研究
• 肥胖模型 肥胖模型

背景情况:

• 柏林脂肪老鼠杂交线 (BFMI) 是研究肥胖和代谢综合征的一个有价值的模型.
• 亚线 BFMI861-S1 和 BFMI861-S2 呈现出体重差异,尽管它们具有很高的遗传相似性和共同的肥胖局部.

研究的目的:

• 为了在BFMI861-S1 x BFMI861-S2高级交叉线上识别额外的体重定量特征位置 (QTL).
• 在这种小鼠模型中,研究遗传因素和饮食对体重调节的影响.

主要方法:

• 在男性BFMI高级交叉线人口中分析每周的体重测量.
• 使用全基因组基因型化数据 (GigaMUGA和顶部SNP基因型化) 进行定量特征位置 (QTL) 分析.

主要成果:

• 在9-20周之间,在15号染色体上检测到全基因组显著的体重QTL,在饮食改变后再次出现.
• 从第6-25周,16号染色体上发现了显著的体重QTL.
• 在Chr 15 (Gpt,Cbx6,Apol6,Apol8,Sun2) 和Chr 16 (Trap1,Rrn3,Mapk1) 上优先选择的候选基因.

结论:

• 在BFMI模型中确定了两个额外的体重QTL.
• 一个新的QTL特别响应饮食干预,强调了遗传与环境之间的相互作用.
• 时间序列数据分析对于发现影响身体重量等复杂特征的新型遗传因素至关重要.