远程传感用于链接映射和基因组预测玉米中常见的耐性

科学领域:

• 植物育种和遗传学
• 农业遥感 农业遥感
• 农作物表型鉴定 农作物表型鉴定

背景情况:

• 为了提高抗病能力的育种对于减轻生物压力导致的作物产量损失至关重要.
• 传统的疾病耐药性的视觉评分 (VS) 是劳动密集型的,限制了吞吐量和可重复性.
• 遥感 (RS) 提供了精简,高通量表型化和标准化结果的潜力.

研究的目的:

• 为了比较传统视觉评分 (VS) 与遥感 (RS) 指数的有效性,用于表型化玉米常见抗 (CR) 耐药性.
• 评估表型化方法对基因组分析的影响,包括链接映射和基因组预测 (GP).
• 使用两种表型化方法识别与CR耐药性相关的基因组区域.

主要方法:

• 一个为期两年的评估试验,使用了三种双亲玉米双倍平体 (DH) 种群.
• 使用常规视觉评分 (VS) 和RS衍生的植被指数,对常见的耐性进行表型化.
• 对VS和RS数据进行了包括链接映射和基因组预测 (GP) 在内的基因组分析.

主要成果:

• 视觉评分 (VS) 通常表现出比RS指数更高的广义遗传性,跨越人口和年龄.
• 链接映射和基因组预测 (GP) 分析表明VS的数据质量更高,由更高的R2值和预测能力证明.
• 无论是VS还是RS的表型化方法都成功地确定了与CR耐药性相关的染色体10上相同的基因组区域,可能是Rp1位点.

结论:

• 虽然VS提供了更高质量的数据,用于对玉米常见耐性进行基因组分析,但RS技术可以成功简化遗传评估过程.
• RS有可能降低成本并增加玉米中抗病表型的试验能力.
• 在染色体10上确定了基因组区域,提供了一个有价值的目标,用于标记器辅助的选择在共同耐的育种计划.