在大鼠中进行PCR基因定型的直肠样DNA采集协议
Audrey E Kaye1, Jacob W Proctor-Bonbright1, Jai Y Yu1,2,3
1Neuroscience Institute, University of Chicago.
bioRxiv : the preprint server for biology
|March 18, 2024
概括
非侵入性直肠扫描为从实验室动物收集DNA提供了一个人道的替代方案. 这种方法提供了可靠的基因型定型结果,与传统的组织采样相美,使得研究结果更快.
科学领域:
- 动物研究伦理 动物研究伦理
- 分子生物学技术分子生物学技术.
- 实验室动物科学 动物科学
背景情况:
- 实验室动物基因定型的标准DNA采集方法涉及组织截肢,导致动物的痛苦和伤害.
- 目前还缺乏用于基因定型的DNA获取的直肠抽样的经过验证,非侵入性协议.
研究的目的:
- 评估各种直肠抽取参数对DNA质量和随后的聚合酶链反应 (PCR) 放大的影响.
- 开发和介绍一个基于证据的,非侵入性协议,用于有效的实验室动物基因定型.
主要方法:
- 系统评估直肠擦拭技术,变化每个样本的擦除数量.
- 对大约1800个基对的目标进行DNA产量和PCR放大成功的评估.
- 从直肠拭子获得的PCR结果与从传统耳样本获得的PCR结果进行比较.
主要成果:
- 用2至8个直肠取取的样本产生了足够的DNA,用于成功的PCR放大目标到1800bp.
- 直肠抽样产生了与耳部剪切样本相比质量的PCR结果.
- 剩余便或细胞碎片的存在不会对PCR结果质量产生负面影响.
结论:
- 直肠抽样是一种可行的,非侵入性方法,用于实验室动物的DNA采集.
- 开发的协议允许使用商业标准PCR试剂进行快速 (3-5小时的子),可重复和人道的基因型鉴定.


