基于质谱的方法来测量甲毒素B1 在甲素固定的胺嵌入组织中的DNA附加物
Medjda Bellamri, Lihua Yao, Rachana Tomar1
1Department of Chemistry, Vanderbilt Ingram Cancer Center, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee 37235, United States.
Chemical research in toxicology
|March 18, 2024
概括
甲素B1 (AFB1) DNA添加物,AFB1-FapyGua,在甲固定组织中是稳定的. 这一突破允许在人类肝脏样本中对AFB1暴露的生物监测,有助于对这种强有力的致癌物进行研究.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 分子生物学分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 非洲毒素B1 (AFB1) 是一种由菌产生的强有力的人类肝脏致癌物,污染了主食.
- AFB1生物激活形成DNA添加物,包括AFB1-N7-瓜 (AFB1-N7-Gua) 和环开放的AFB1-FapyGua添加物.
- AFB1-FapyGua添加物与AFB1-诱导的G → T突变和肝癌有关,但它们在人类中的检测受到组织可用性的限制.
研究的目的:
- 为了评估AFB1-FapyGua添加物的稳定性,在甲固定式嵌 (FFPE) 组织中.
- 建立一种检测FFPE人类肝脏样本中的AFB1-FapyGua添加物的方法,用于生物监测.
- 克服与甲固定相关的核酸质量挑战,以准确量化添加物.
主要方法:
- 新生小鼠接触AFB的情况1.
- 使用离子陷和轨道陷质谱仪在新鲜冷和FFPE肝脏组织中分析AFB1-FapyGua附加物.
- 开发FFPE样本的DNA去交叉链接检索流程.
主要成果:
- 环开放的AFB1-FapyGua添加物在甲固定和DNA脱交联过程中是稳定的.
- 在FFPE肝脏中检测到AFB1-FapyGua附加物,其水平与新鲜冷肝脏相当.
- 轨道飞行器MS2的量化极限为每10^8个基中有4.0个基,含有0.8μg的DNA.
结论:
- 在FFPE肝组织中,AFB1-FapyGua附加物可靠地检测到.
- 这种DNA检索技术可以在有风险的人群中对AFB1暴露进行生物监测.
- 这些发现促进了使用可访问的FFPE样本研究AFB1相关的肝癌发生.
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