使用fMRIPrep和Nilearn进行休息状态fMRI连接中的无声化策略的持续评估
Hao-Ting Wang1, Steven L Meisler2,3, Hanad Sharmarke1
1Centre de recherche de l'institut Universitaire de gériatrie de Montréal (CRIUGM), Montréal, Québec, Canada.
PLoS computational biology
|March 18, 2024
概括
这项研究为功能磁共振成像 (fMRI) 拒绝策略提供了一个可重现的基准,比较诸如 scrubbing 和全球信号回归等方法,以改善大脑连接分析.
科学领域:
- 神经成像是一种神经成像.
- 计算神经科学是一种神经科学.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 功能磁共振成像 (fMRI) 连接性分析需要减少非神经元噪声.
- 由于软件进化,fMRI现有的否定基准可能会过时.
- 实践者需要可靠的指导来选择适当的fMRI拒绝策略.
研究的目的:
- 为fMRI连接性分析提供一种新的,可重复的无噪点基准.
- 通过使用多个数据集和指标,评估一系列的除策略.
- 为了促进fMRI拒绝软件的持续评估和比较,特别是fMRIPrep.
主要方法:
- 根据fMRIPrep.开发一个基于fMRIPrep.的拒绝基准框架.
- 包含多种多样的拒绝策略,数据集和评估指标.
- 在Neurolibre服务器上使用Jupyter Book实现可重复框架.
主要成果:
- 大多数基准测试结果与之前关于fMRI拒绝的文献一致.
- 洗与全球信号回归相结合,通常有效消除噪声.
- 在不同数据集和fMRIPrep版本的策略表现中观察到不一致.
结论:
- 开发的基准为fMRI社区提供了指导方针,并促进了可重现的研究.
- 持续评估fMRI拒绝方法是必不可少的.
- 具体的拒绝策略的适用性因分析要求和数据特征而有所不同.
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