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Cell-Free DNA Integrity Analysis in Urine Samples
Published on: January 5, 2017
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通过基因组转录组和单细胞蛋白标志物分析,转移性上道泌尿瘤的演变
Kentaro Ohara1,2, André Figueiredo Rendeiro2,3,4,5, Bhavneet Bhinder2,3,4
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medicine, New York, NY, 10065, USA.
Nature communications
|March 19, 2024
概括
转移性上道泌尿系统癌 (UTUC) 的分子亚型尽管在原发性和转移性瘤之间发生了基因组变化,但稳定. 这项研究揭示了UTUC进化中保存的分子亚型和免疫特征.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 转移性上道泌尿道癌 (UTUC) 的分子格局仍然不太清楚.
- 关于原发性和转移性UTUC之间的基因组和转录组变异的知识有限.
研究的目的:
- 研究UTUC的分子特征和从初级到转移性网站的演变.
- 在个体患者中识别初级和转移性UTUC之间的保存和分离的分子特征.
主要方法:
- 整体外因子测序,RNA测序和成像质细胞计的整合.
- 来自44个瘤样本 (28名患者) 的癌症,免疫和树皮细胞的空间分辨率单细胞分析.
- 对340,798个单细胞进行分析,以评估蛋白质标记物和分子亚型.
主要成果:
- 在初级和转移性UTUC瘤之间,可操作的基因组变异经常存在差异.
- 分子亚型成员和免疫衰竭特征在初级和转移性部位都稳定.
- 分子和免疫亚型在批量测序和单细胞蛋白标记分析之间显示出一致性.
结论:
- 尽管基因组不一致,但在初级和转移性UTUC之间,分子亚型高度保存.
- 免疫特征和分子亚型为了解UTUC进展提供了稳定的特征.
- 单细胞分析提供了UTUC异质性和保护的全面视图.
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