在扩散MRI中自动绘制残余扭曲严重性的自动映射
Shuo Huang1,2, Lujia Zhong1,3, Yonggang Shi1,2,3
1Stevens Neuroimaging and Informatics Institute, Keck School of Medicine, University of Southern California (USC), Los Angeles, CA 90033, USA.
概括
一种新的深度学习方法准确地绘制了扩散MRI (dMRI) 数据中的残余扭曲. 这种工具有助于通过识别剩余文物区域来改善大脑连接分析,即使数据有限.
科学领域:
- 神经成像是一种神经成像.
- 医学图像分析 医学图像分析
- 机器学习 机器学习
背景情况:
- 敏感性诱导的扭曲是扩散MRI (dMRI) 中常见的工件,影响连接性分析.
- 现有的扭曲校正方法往往会留下残留的工件,这些工件在不同受试者和大脑区域之间有所不同.
- 为了指导下游分析,需要对剩余扭曲严重性的voxel级地图.
研究的目的:
- 开发和验证一个监督的深度学习网络,用于预测dMRI中的残余扭曲严重性图.
- 提供一个工具,可以通过量化剩余的扭曲来为连接分析提供信息.
- 创建一种有效的方法,适用于具有不同数据采集参数的大规模数据集.
主要方法:
- 一个受监督的深度学习网络被训练使用结构相似度指数 (SSIM) 来测量相反的相位编码 (PE) 方向的光纤方向分布 (FOD).
- 该模型只需要b0图像和扭曲校正方法的输出作为测试期间的输入.
- 该模型在HCP-Aging数据集上进行了训练,并在英国生物库数据上进行了测试.
主要成果:
- 深度学习模型的训练,验证和测试错误率很低.
- 生成的严重性地图显示了在两个数据集中与光纤方向分布 (FOD) 完整性指标的良好相关性.
- 该方法的效率很高,每人大约在一秒钟内生成严重程度地图.
结论:
- 拟议的深度学习方法有效地为dMRI生成voxel级残余扭曲严重性图.
- 这种方法为提高扩散MRI连接性分析的准确性提供了有价值的工具.
- 这种方法是高效的,适合大规模的神经成像研究,包括那些单向dMRI数据.


