在东亚的二次接触期间对室内老鼠基因组的选择力推断

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 进化生物学 进化生物学
• 哺乳动物遗传学 哺乳动物遗传学

背景情况:

• 家鼠 (Mus musculus) 是一个全球分布的共生物种.
• 人类活动促进了基因上不同的室内老鼠亚种之间的二次接触和混合.
• 了解Mus musculus中的混合模式,可以深入了解进化选择力.

研究的目的:

• 研究东亚室内小鼠的遗传混合模式,重点研究和肌肉的亚种.
• 确定驱动观察到的混合模式的因素,特别是在Y染色体固定方面.
• 探索选择在塑造杂交基因组,特别是免疫和嗅觉基因中的作用.

主要方法:

• 对163个室内老鼠样本进行全基因组分析,重点关注东亚种群.
• 自体和Y染色体混合物的比较分析.
• 计算机模拟以模拟Y染色体在不同性别比率下的固定.
• 研究特定基因组区域的选择特征,包括免疫和嗅觉基因.

主要成果:

• 在日本和中国南部观察到Mus musculus亚种castaneus和musculus之间存在大量的混合物.
• 所有东亚样本都表现出肌肉类哈普洛组的Y染色体,无论自身染色体混合水平如何.
• 计算机模拟支持了这样一个假设:男性与女性出生比例的轻微增加可以导致肌肉类型Y染色体的偏好固定.
• 日本家庭小鼠基因组显示了状遗传组件的局部丰富,特别是在免疫相关的基因和大型鼻/嗅觉受体基因集群中.

结论:

• 这项研究揭示了东亚室内老鼠种群中复杂的混合动力,由包括性别染色体冲突和潜在选择在内的因素驱动.
• 性比扭曲,受性染色体基因 (Slx和Sly) 的影响,可能在肌肉类型Y染色体的固定中发挥了作用.
• 杂交后的选择有利于在日本室内小鼠基因组的特定区域的状基因,特别是在免疫和嗅觉受体基因中.
• 嗅觉识别似乎是塑造混合家庭老鼠种群基因组的一个重要因素.