用于3D器官型肝脏模型深度表型分析的蛋白质组工作流程

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 药物发现 药物发现 药物发现

背景情况:

• 器官类型的人体组织模型对药物发现有价值,使药物动力学和毒性研究成为可能.
• 蛋白质基因分析对于将表型变化与特定的生物标联系起来至关重要.
• 不同蛋白质组工作流对3D组织模型的影响仍然未被评估.

研究的目的:

• 为了比较12个基于质谱的全球蛋白质组工作流程的性能,用于分析初级人类肝脏球状体.
• 评估细胞输入,溶解协议和量化方法对蛋白质组结果的影响.
• 确定一种标准化,高通量兼容的工作流程,用于深度表型化有机型微组织.

主要方法:

• 基于质谱学的12个全球蛋白质原子工作流被测试在主要的人类肝脏球体上.
• 协议在细胞输入,溶解方法和量化策略方面有所不同.
• 用一种与代谢功能障碍相关的脂肪性肝病模型来评估途径识别.

主要成果:

• 在工作流中观察到蛋白质识别数和亚细胞区间偏差的重大差异.
• 工作流的选择显著影响运输体和药物代谢酶的量化.
• 一个标准化的热溶解工作流稳定地确定了关键疾病途径,即使输入最小 (1500个细胞).

结论:

• 蛋白质组工作流的选择对有机型组织模型中的分析结果产生了关键的影响.
• 一个标准化,高通量兼容的热溶解工作流可以从有限的生物样本中进行可扩展的深度表型化.
• 这项研究增强了蛋白质基因分析对微组织表型查的实用性,推动了药物发现.