在UC-MSC中对负相关基因进行全转录组扫描和验证
Linghan Tian1,2,3, Weibin Wang4,5, Xuzhen Li4,5
1Department of Yunnan Tumor Research Institute, Kunming, 650118, China.
Heliyon
|March 21, 2024
概括
人类带介质干细胞 (UC-MSCs) 在通过时失去多能性. 基因KIFC1和UBE2C是保持茎状性的关键,可以作为再生医学中UC-MSC质量的生物标志物.
科学领域:
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 再生医学是一种再生医学.
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 人类带介质干细胞 (UC-MSCs) 对于再生医学至关重要,因为它们的分化和免疫调节潜力.
- 为了临床用途进行大规模培养,需要了解影响干度的经路依赖性变化.
- 长期种植可能导致多能分化能力的丧失,影响治疗疗效.
研究的目的:
- 通过不同的通道调查UC-MSCs的生物特征和转录性改变.
- 为了确定关键的基因和与UC-MSCs的茎维护相关的途径.
- 评估UC-MSC再生医学质量控制的潜在生物标志物.
主要方法:
- 来自五个通道 (P1,P3,P5,P10,P15) 的UC-MSC的隔离和培养.
- 综合分析包括形态学,细胞标记,分化能力和衰老分析.
- 高通量转录组测序,模糊的C-Means集群 (FCM) 和权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 来识别枢纽基因.
- 基因沉默实验用于评估已识别的基因对UC-MSC干性的功能影响.
主要成果:
- 在通道中,UC-MSC保持了类似的表面标记 (CD73,CD105,CD90,CD34,CD45,HLA-DR).
- 晚期的UC-MSCs表现出更长的增殖时间,增加了衰老标志物 (SA-β-gal) 和减少了多能性标志物 (NANOG,OCT4,SOX2,KIF4A).
- 在晚期UC-MSC中观察到KIFC1和UBE2C的下调,这些基因与干性维护有关.
结论:
- 在早期的UC-MSC中,KIFC1和UBE2C的表达很高,在体外扩张时下降.
- 这些基因在调节UC-MSC增殖,分化和茎状维护方面发挥着至关重要的作用.
- 建议KIFC1和UBE2C作为评估UC-MSC质量的新生物标志物,用于再生医学应用.
