来自哺乳动物tRNA基因的重复序列家族

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子进化分子进化
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 短间隔的重复DNA序列 (SINEs) 在哺乳动物基因组中很丰富.
• SINEs具有RNA聚合酶III促进体,可能通过RNA中间体帮助它们的转移.
• 许多SINE家族的进化起源仍然不清楚.

研究的目的:

• 研究哺乳动物中SINEs和转移RNA (tRNA) 基因之间的关系.
• 为了确定SINE促进子区域是否来自tRNA基因.
• 探索SINE家族在类动物Galago crassicaudatus的进化起源.

主要方法:

• 来自Galago crassicaudatus,老鼠和小鼠的SINE家族的序列比较分析.
• 在SINE序列和人类氨酸tRNA基因之间的同质性评估.
• 进行比较基因组学以确定进化关系.

主要成果:

• 加拉戈单体和II型SINE家族分别表现出68%和62%的同质性,与人类氨酸tRNA.
• 鼠标标识符和小鼠B2 SINE家族与阿兰因和血清tRNA基因有密切的序列关系.
• 确定了各种哺乳动物SINE和tRNA基因之间的显著序列相似性.

结论:

• 哺乳动物的SINE,特别是它们的促进子区域,很可能来自转移RNA (tRNA) 基因.
• 许多SINE家族代表了放大tRNA伪基因.
• 这一发现为推动哺乳动物基因组中重复性DNA元素放大带来的进化机制提供了洞察力.