一个开源的FACS自动化系统用于高通量细胞生物学
Diane M Wiener1, Emily Huynh1, Ilakkiyan Jeyakumar1
1Chan Zuckerberg Biohub-San Francisco, San Francisco, California, United States of America.
PloS one
|March 21, 2024
概括
我们开发了一个用于光激活细胞分类 (FACS) 的自动化平台,以加速细胞工程. 这个系统减少了93%的劳动力,并为高通量生物学标准化了细胞选择.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 生物技术是生物技术.
- 生物工程是生物工程.
背景情况:
- 基因编辑的进步使得大规模的细胞工程成为可能.
- 目前的电池制造和处理方法需要加速.
- 光激活细胞分类 (FACS) 对于选择工程细胞至关重要,但是劳动密集型,缺乏自动化.
研究的目的:
- 开发一个集成的硬件和软件平台,用于自动化光激活细胞分类 (FACS).
- 为了实现高吞吐量,为工程细胞选择可走的细胞.
- 为缺乏应用程序界面 (API) 的仪器自动化提供通用解决方案.
主要方法:
- 围绕商业FACS仪器开发了一个集成的软件和硬件平台.
- 自动样品处理,仪器控制和算法生成分类门.
- 为更广泛的可访问性设计了一个开源系统和构建文档.
主要成果:
- 实现了FACS样本处理的"走路"功能.
- 通过自动化,减少了93%的手工劳动.
- 消除了操作员错误和标准化的门口条件,提高了一致性.
结论:
- 自动化FACS平台显著加速了工程细胞的选择.
- 开发的仪器自动化策略适用于其他缺乏API的仪器.
- 该平台的开源性质促进了高通量细胞生物学工具的协作生态系统.
