全基因组的CRISPR查发现,TOB1通过IFN和EGFR介导的途径作为FMDV感染的关键宿主因子
Gaochuang Peng1,2, Tianran Liu1,2, Xiaolan Qi2
1State Key Laboratory of Animal Biotech Breeding, College of Biological Sciences, National Engineering Laboratory for Animal Breeding, Frontiers Science Center for Molecular Design Breeding, China Agricultural University, Beijing, China.
PLoS pathogens
|March 21, 2024
概括
研究人员确定TOB1是关键的宿主因子,足口病病毒 (FMDV) 感染. 淘汰TOB1通过调节免疫基因和免疫路径,显著抑制了FMDV,为FMD控制和疫苗开发提供了新的途径.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 口疫病毒 (FMDV) 对牲畜构成重大威胁,但宿主病原体相互作用仍未得到充分研究,阻碍了有效控制和疫苗开发.
- 了解宿主因素对于制定针对FMDV的策略至关重要.
研究的目的:
- 通过全基因组的CRISPR/Cas9屏幕识别FMDV感染所必需的新型宿主基因.
- 阐明 FMDV 感染周期中已识别的宿主因子的功能作用.
主要方法:
- 设计并使用猪基因组规模的CRISPR/Cas9淘汰库进行高通量查.
- 在IBRS-2细胞中进行FMDV后的选择,以识别丰富的基因.
- 在小鼠中进行了后续研究,包括基因淘汰,mRNA/蛋白质分析,以及体内FMDV挑战.
主要成果:
- 确定了几种以前未报告的宿主基因,这些基因对FMDV感染至关重要.
- 确定TOB1 (ERBB2.1的传感器) 是一个关键的宿主因素,TOB1-Knockout显著抑制了FMDV.
- 证明TOB1调节RIG-I和MDA5表达,影响CEBPA积累,并通过EGFR/ERBB2通路影响FMDV吸附/内化.
- 在体内使用淘汰赛小鼠确认了TOB1在FMDV感染中的抑制作用.
结论:
- TOB1是一个关键的宿主因子,可以积极调节猪中FMDV感染.
- 准TOB1为FMDV控制和治疗干预提供了一个潜在的战略.
- 这项研究提供了与FMDV病原体和疫苗设计相关的宿主-病原体相互作用的宝贵见解.
