HDX-MS发现,随着序列域激活的部分展开控制了细胞压力标记物的凝结

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 细胞生物学 细胞生物学
• 生物物理学的生物物理.

背景情况:

• 细胞为环境感知和适应而形成动态凝聚物.
• 聚A结合蛋白 (Pab1) 是一个关键的压力颗粒标记物,在细胞应激过程中经历凝结.
• 由于有限的结构探测技术,蛋白质凝结背后的分子机制仍然不太了解.

研究的目的:

• 通过-交换/质谱学研究聚A结合蛋白 (Pab1) 凝结的机制.
• 阐明导致压力下Pab1凝结的结构变化和相互作用.
• 了解凝结如何促进细胞应激适应.

主要方法:

• 使用-交换/质谱法 (HDX-MS) 来探测蛋白质结构.
• 在凝聚物种群中分析结构异质性.
• 研究RNA识别基因 (RRMs) 在Pab1凝聚中的作用.

主要成果:

• 在Pab1的四个RNA识别基因 (RRMs) 在凝结过程中表现出部分展开,在热和pH应力中观察到类似的变化.
• HDX-MS揭示了结构异质性,确定了对凝结物的相互作用网络至关重要的区域.
• 提出了一种"顺序激活"的模型,其中RRMs展开并顺序结合以形成凝结物.

结论:

• Pab1凝结是由RRMs的顺序激活和展开驱动的,由热力学特异性控制.
• 凝结利用热力学特异性来调节对各种压力的急性反应.
• 这项研究促进了对驱动蛋白质凝聚的相互作用及其在应激适应中的作用的理解.