从组织病理学部分进行三维重建:系统性审查.
Alexander Kurz1, Heimo Müller2, Jakob N Kather3
1Digital Biomarkers for Oncology Group, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
概括
从组织学部分进行三维 (3D) 重建提供了新的空间分析可能性. 审查最近的研究显示了可用的软件工具,但突出需要共同的文件格式和计算机辅助分析.
科学领域:
- 病理学 病理学 病理学
- 生物医学成像技术 生物医学成像技术
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 传统的病理学分析依赖于二维组织学幻灯片.
- 这限制了对组织架构的全面空间理解.
- 三维 (3D) 重建提供了先进的分析潜力.
研究的目的:
- 从组织学部分进行3D重建的最新进展进行审查.
- 识别组织类型,切口参数和重建方法.
- 分析现有的软件工具和未来的研究方向.
主要方法:
- 对2018年以后发表的科学文献进行系统审查.
- 分析提取的组织类型,切口厚度和切口数量.
- 评估软件要求和现有的3D重建工具.
主要成果:
- 许多研究表明,从组织学部分进行3D重建.
- 已经成功地重建了各种各样的组织类型.
- 有免费和商业软件解决方案可用于3D重建.
结论:
- 从组织学部分进行3D重建在技术上是可行的,使用当前的软件.
- 未来的工作应该专注于标准化 (例如,常见的文件格式) 和计算分析.
- 这种方法有望增强病理学中的空间分析.
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