结合基于scRNA-Seq的糖解相关预后模型与实验验证,ZFP41被确定为HCC的潜在预后生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• 肝细胞癌 (HCC) 是一种流行癌症,结果不佳,受瘤异质性的影响.
• 葡萄糖溶解与HCC进展,治疗反应和患者预后密切相关.
• 确定可靠的生物标志物对于改善HCC管理和治疗策略至关重要.

研究的目的:

• 通过研究糖解异质性来发现肝细胞癌 (HCC) 的新型预后生物标志物.
• 为HCC患者开发和验证与糖溶解相关的预后模型.
• 探索已识别的生物标志物作为HCC治疗点的潜力.

主要方法:

• 整合单细胞RNA测序和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据,以识别与糖解相关的标记基因.
• 使用考克斯回归和最小绝对收缩和选择运算符 (LASSO) 考克斯回归构建了一个预后模型.
• 用国际癌症基因组联盟 (ICGC) 数据验证了该模型,并进行了体外实验.

主要成果:

• 一个与糖溶解相关的预后模型有效地将HCC患者分为高风险和低风险组.
• 该模型显示了准确的预测能力 (AUC=0.763在3年),并确定了指蛋白41 (ZFP41) 作为关键基因.
• 高风险患者表现出免疫检查点基因表达的增加,这表明免疫治疗可能有好处;ZFP41在瘤组织上升调节,并在体外促进HCC细胞恶性瘤.

结论:

• 糖溶解相关的预后模型和ZFP41作为HCC的潜在预后生物标志物.
• 在HCC细胞活力,增殖,迁移,入侵和糖解中,ZFP41起着重要作用.
• ZFP41代表了改善肝细胞癌治疗策略的潜在治疗标.