机器学习框架开发了中性粒细胞外细胞陷模型,用于临床结果和肺腺癌癌中的免疫治疗反应
A Xuan Han1, B Yaping Long2,3, C Yao Li2,4
1Department of General Surgery, Aerospace Central Hospital, 15 Yuquan Road, Haidian District, Beijing, China.
概括
中性粒细胞外细胞陷 (NETs) 与肺腺癌 (LUAD) 的进展有关. 这项研究确定了预后性NETs特征,并突出了脂scramblase 1 (PLSCR1) 作为LUAD患者的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 中性细胞外细胞陷 (NETs) 越来越多地被认为是它们在癌症进展和转移中的作用.
- 肺腺癌 (LUAD) 是癌症死亡的主要原因,需要新的预后标志物和治疗策略.
研究的目的:
- 为LUAD患者开发一个预后NETs签名.
- 在LUAD中识别与NET相关的途径中的潜在治疗点.
- 为了研究脂scramblase 1 (PLSCR1) 在LUAD进展中的作用.
主要方法:
- 在TCGA-LUAD数据上的共识聚类和权重基因同表达网络分析 (WGCNA).
- 机器学习算法 (包括Coxboost) 来构建预后签名.
- 多omics分析,体外/体内实验和组织微阵列 (TMA) 验证.
主要成果:
- 在LUAD中发现了两种与NETs相关的不同集群;C2集群与"热"瘤表型和更好的预后相关.
- 开发了一个预后NETs签名,预测整体存活率,并与免疫抑制的微环境联系在一起.
- 抑制PLSCR1抑制了LUAD细胞生长,上皮细胞-介质细胞过渡 (EMT) 和中性粒细胞的NET形成;PLSCR1表达与预后相关.
结论:
- 一个新的预后NETs签名有助于Luad患者的风险分层.
- PLSCR1被确定为LUAD进展中的关键基因,影响瘤生长,EMT和NET形成,因此代表了一个潜在的治疗标.
- 这项研究提供了关于NETs在LUAD中的作用的见解,并为开发向疗法和提高免疫疗法疗效提供了途径.
