在实验室规模的生物反应器中,氧气介导的动员和抗生素耐药性的同时发生,使用了metagenomic binning

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 亚致命抗生素诱导反应性氧物种 (ROS),促进抗生素耐药性基因 (ARG) 通过移动遗传元素 (MGE) 传播.
• 溶解氧 (DO) 水平在ROS压力下的ARG流动性中的作用尚不清楚.

研究的目的:

• 调查不同DO水平 (高氧,正常,低氧) 对ARG和MGE流动性和同时发生的影响.
• 为了确定潜在的宿主和促进ARG在不同氧气条件下传播的遗传元素.

主要方法:

• 用转基因组合和分类来分析ARG和MGE.
• 实验室规模的生物反应器在六个月内模拟了不同的DO条件.
• 高质量的元基因组组装基因组 (MAG) 被恢复和分析.

主要成果:

• 在高氧和正常的条件下,ARG数量增加,但在低氧条件下下降.
• 在所有DO级别中,MGE数量增加.
• 在高氧化条件下,ARG-MGE的同时发生率更高,这表明ARG的流动性增加.
• 机会性病原体被确定为关键ARG的宿主,通常在移动元件上同定位.

结论:

• 溶解氧水平显著影响抗生素耐药性基因的移动性和传播.
• 过氧性条件通过在病原体中增加与MGEs的同时发生,促进ARG流动性.
• 控制氧气水平可能是缓解ARG在环境中的传播的策略.