来自印度的羊和山羊病毒RPO30基因的结构和序列分析
Gundallahalli Bayyappa Manjunatha Reddy1, Krishnappa Sumana1, Revanaiah Yogisharadhya1
1ICAR-National Institute of Veterinary Epidemiology and Disease Informatics, Bengaluru, Karnataka, India.
The veterinary quarterly
|March 25, 2024
概括
印度的水和山病毒在其RPO30基因中显示出不同的遗传标记,有助于物种分化. 这一发现支持使用同源疫苗来有效控制小反动物中这些卡普里波克病毒疾病.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子流行病学分子流行病学
- 动物基因组学 动物基因组学
背景情况:
- 绵羊病毒 (SPPV) 和山羊病毒 (GTPV) 是经济上重要的病毒 (CaPV) 疾病,影响全球小型反动物,包括印度.
- 对抗原相似的CaPV,如SPPV,GTPV和LSDV的物种差异化需要分子方法.
研究的目的:
- 调查在印度传播的SPPV和GTPV的分子流行病学和宿主特异性.
- 分析RNA聚合酶子单元-30 kDa (RPO30) 基因的序列和结构,以寻找特定物种的标记物.
主要方法:
- 从2015年至2023年期间收集的29个野外隔离物 (19只绵羊,10只山羊) 中对全长RPO30基因进行测序和结构分析.
- 生殖基因分析,多个序列对齐和RPO30蛋白质的二次结构分析.
主要成果:
- 遗传学分析将CaPV分离物聚集成SPPV,GTPV和LSDV组.
- 在所有印度SPPV分离品的RPO30基因中发现了一种保存的21核酸删除.
- 在RPO30基因中发现了特定物种的保存残留物/动图,适用于基因型标记物.
- 对RPO30蛋白的二次结构分析显示,它与疫苗病毒E4L蛋白有相似之处.
结论:
- RPO30基因含有特定物种的标记物,用于区分印度SPPV和GTPV分离物.
- 观察到的宿主偏好突出了针对性控制策略的需要.
- 建议采用同源的疫苗接种策略,以保护小反动物免受capripoxvirus感染.
