为单细胞应用优化小鼠消化协议
Jake N Robertson1, Henry Diep1, Alexander R Pinto1,2
1Centre for Cardiovascular Biology and Disease Research, Department of Microbiology, Anatomy Physiology and Pharmacology, School of Agriculture, Biomedicine and Environment, La Trobe University, Bundoora, Victoria, Australia.
Physiological genomics
|March 25, 2024
概括
选择正确的单细胞制备方案对于准确的小鼠细胞分析至关重要. 不同的协议显著改变细胞产量,影响下游单细胞RNA测序和流细胞测量研究.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 单细胞欧米克技术的技术
- 生物技术和生物工程
背景情况:
- 单细胞技术使得细致的细胞表征成为可能.
- 准备脏单细胞悬浮剂的现有方案有很大的差异.
- 这种变化导致了细胞产量和下游分析的差异.
研究的目的:
- 为了比较三种不同的单细胞制备方案,用于小鼠脏组织.
- 评估不同解离协议对细胞异质性的影响.
- 引导研究人员选择针对特定细胞丰富的最佳方案.
主要方法:
- 从雄性和雌性C57BL/6小鼠脏中制备单细胞悬浮液.
- 使用了三个协议:一个scRNAseq协议 (P1),一个Miltenyi Biotec套件 (P2) 和一个实验室开发的协议 (P3).
- 流细胞计被用来量化主要的细胞类型.
主要成果:
- 协议P2的结果显著减少了白细胞和B型插细胞的数量.
- 协议P1和P3显示大多数细胞类型的产量相似.
- 协议P1显著丰富了内皮细胞和骨髓细胞;在粒细胞和光滑肌肉细胞中发现了性别差异.
结论:
- 选择单细胞消化方案极大地影响脏细胞异质性.
- 不同的协议导致细胞类型产量的显著变化.
- 这种比较分析有助于研究人员在单细胞研究中选择向脏细胞类型丰富的协议.
