杜维利西布和埃加尼利西布可以治疗癌症和COVID-19吗? 从MD模拟和增强型采样中获得的分子层面的洞察力

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 病毒学 病毒学
• 计算化学的计算化学

背景情况:

• SARS-CoV-2 变种构成全球健康风险,细胞因子风暴导致严重疾病.
• 卷入癌症和COVID-19的细胞因子风暴通常由PI3Kγ介导.
• 现有的抗癌药物可能提供对病毒感染和癌症的双重治疗潜力.

研究的目的:

• 调查抗癌药物杜维利西布和埃加内利西布作为COVID-19和癌症的双重疗法的潜力.
• 阐明其协同疗效背后的分子机制.
• 确定特定的SARS-CoV-2点及其与这些候选药物的相互作用.

主要方法:

• 用原子模拟来分析药物向相互作用.
• 计算了结合的自由能量和形状变化.
• 改进的采样技术和复制模拟评估了药物标结合的稳定性.
• 辐射分布函数 (RDF) 用于分析分子近距离.

主要成果:

• 杜维利西布和埃加内利西布除了PI3Kγ外,还对SARS-CoV-2主要蛋白酶 (Mpro) 具有特异性.
• 显著的负键自由能量表明与Mpro.有强烈的相互作用.
• 复杂化导致机械硬的活性部位,变形最小.
• 模拟结果显示,药物与Mpro催化二 (His41和Cys145) 非常接近.

结论:

• 杜维利西布和埃加内利西布被确定为对抗COVID-19和抗癌应用的有希望的双重用途药物.
• 这些药物潜在地针对Mpro来抑制病毒复制和PI3Kγ来缓解细胞因子风暴.
• 确定了导致药物相互作用的关键热点残留物,为药物开发提供了洞察力.