来自与SOPHiA DDM HRD 解决方案相关联的 Oncomine Comprehensive Assay Plus 的同源重组缺陷的预测

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物标志物开发 生物标志物开发

背景情况:

• 聚ADP-ribose) 聚合酶 (PARP) 抑制剂对于卵巢癌的向治疗在同源重组缺陷 (HRD) 的患者中至关重要.
• 准确预测HRD对于有效的患者分层和治疗选择至关重要.

研究的目的:

• 使用SOPHiA DDM HRD解决方案开发基因组完整性 (GI) 指数的预测模型.
• 确定基因组不稳定性指标 (GIM) 的切断值,该值来自与GI指数相关的OCA Plus,与GI指数相关.

主要方法:

• 利用87例高度卵巢血清癌病例的数据.
• 开发了一个同源的重组缺陷预测模型,包含HRD分数组件:%LOH,%TAI,%LST和GIM.
• 雇员对模型构建的后勤回归进行了惩罚.

主要成果:

• 最终的预测模型方程被确定为: -21.77 + 0.200 × GIM + 0.102 × %LOH + 0.037 × %TAI + 0.261 × %LST.
• 人力资源发展部状态预测模型在测试组中实现了0.958的准确性.
• 使用GIM截止值为16的,HRD状态预测的准确性为0.911.

结论:

• 康明综合试验Plus证明了作为同源重组缺陷生物标志物的可靠性.
• 开发的HRD预测模型为评估卵巢癌的基因组完整性提供了有价值的工具.