识别和初步验证不同表达的基因作为与动脉样硬化相关的候选生物标志物

科学领域:

• 心血管研究研究心血管研究
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 动脉样硬化 (AS) 是导致心血管和脑血管疾病的全球主要原因.
• 确定可靠的生物标志物对于早期诊断和AS的有效管理至关重要.

研究的目的:

• 为了确定关键的差异表达基因 (DEGs),可以作为AS的预测生物标志物.
• 阐明与这些DEGs相关的生物功能和途径.
• 在临床前模型中验证已识别的枢纽DEG的诊断潜力.

主要方法:

• 利用来自 GEO 数据库的微阵列数据集来识别 DEG 和 DE-microRNA (miRNA).
• 进行了基因本体学 (GO) 和KEGG通路丰富分析以进行功能注释.
• 构建蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 和DEGs-DE-miRNAs网络以识别枢纽基因.
• 在AS的仓鼠模型中验证了枢纽DEG,并使用接收器操作特征 (ROC) 曲线分析评估了诊断准确性.

主要成果:

• 确定了203个DEG和10个DE-miRNA,其中6个被选为枢纽DEG.
• 核心DEG在免疫反应,炎症和血管生成途径上显著丰富.
• 枢纽DEG显示了AS的有前途的诊断潜力 (AUC:0.7810.887).
• 在AS仓鼠模型中验证了TNF-α,CXCL8,CCL4,IL-1β,CCL3和CCR8的蛋白质表达增加.

结论:

• 已识别的TNF,CXCL8,CCL4,IL1B,CCL3和CCR8基因显示出潜在的AS诊断的预后生物标志物.
• 这些基因与AS病变发生相关的关键生物过程有关.
• 需要在临床环境中进行进一步的验证,以确认它们的实用性.