评估和优化酸-pH和直接溶解RNA提取用于在整个唾液中检测SARS-CoV-2RNA
Brayden LaBute1, Jackie Fong1,2, Farinaz Ziaee3
1Department of Biomedical Sciences, University of Windsor, Windsor, ON, Canada.
Scientific reports
|March 26, 2024
概括
两个具有成本效益的唾液处理方法,即酸-pH和直接溶解,被优化为通过RT-qPCR对SARS-CoV-2查. 这两种方法都可靠地检测病毒,并提供可访问,高效的COVID-19测试替代方案.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- COVID-19 给全球健康和经济带来了重大挑战.
- 针对SARS-CoV-2的有效查对于疾病缓解至关重要.
- 唾液采集提供了一个不那么侵入性和更具成本效益的替代方案,以鼻口腔拭子.
研究的目的:
- 优化两种不同的,具有成本效益的唾液样本处理方法,用于对SARS-CoV-2的RT-qPCR测试.
- 评估优化的酸-pH和直接溶解协议的可靠性和可重复性.
- 建立一个具有成本效益的平台,以使用唾液进行广泛的SARS-CoV-2查.
主要方法:
- 优化两种唾液样本处理方法:基于酸-pH的RNA提取和直接溶解.
- 利用在2.0毫升管中收集样品,以减少成本和人力需求.
- 验证了使用β-2微球蛋白 (B2M) mRNA作为内部控制的协议,并评估了SARS-CoV-2 N1基因的检测极限.
主要成果:
- 酸-pH和直接溶解协议都在检测B2M mRNA方面表现出高可靠性 (分别为97%和96.7%).
- 与酸-pH相比,直接溶解显示B2M的周期值 (Ct) 值明显更高.
- 直接溶解的N1基因检测极限低于直接溶解的Acid-pH (≤5副本/μL),而N1Ct值在阳性样本中直接溶解时始终更高.
结论:
- 优化的酸-pH和直接溶解协议为唾液中SARS-CoV-2查提供了可靠和可复制的方法.
- 这些具有成本效益的技术减少了对专门设备和人员的需求,促进了更广泛的可访问性.
- 开发的协议支持实施有效和可访问的基于唾液的查平台,用于COVID-19和潜在的其他病毒性疾病.
