通过结合Iso-Seq和RNA-Seq在Zeugodacus tau中识别与丸发育相关的基因
Peipei Liu1,2,3,4,5, Ziniu Li1,2,3,4,5, Qiuyuan Zhang1,2,3,4,5
1National Key Laboratory for Germplasm Innovation & Utilization of Horticultural Crops, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei, China.
Frontiers in cell and developmental biology
|March 26, 2024
概括
了解侵袭性害虫Zeugodacus tau的丸发育对于无菌昆虫技术至关重要. 确定了参与新陈代谢和精子生成的关键基因,它们的淘汰影响了后代化率.
科学领域:
- 昆虫学 昆虫学是一门学科.
- 基因组学就是基因组学.
- 虫害管理 虫害管理 虫害管理
背景情况:
- 泽古达克斯 (Zeugodacus tau) 是一种侵入性害虫,需要有效的控制方法.
- 无菌昆虫技术 (SIT) 是一种对Z. tau.有前途的控制策略.
- 了解Z. tau的丸发育对于优化SIT至关重要.
研究的目的:
- 在Z. tau丸发育过程中识别差异表达基因 (DEG).
- 研究特定的代谢和精子生成相关基因在Z. tau繁殖中的作用.
- 为了提供对特弗利特虫害控制的保存基因的洞察力.
主要方法:
- 使用PacBio Iso-Seq和RNA测序来分析基因表达.
- 从Z. tau的丸中构建了RNA-Seq库,这些丸处于不同的发育阶段 (化后的1,6和11天).
- 用RNA干扰 (RNAi) 进行基因淘汰实验.
主要成果:
- 755和865个DEG分别在比较第6天与第1天和第11天与第1天的丸时被确定.
- 在视网醇代谢,维生素B6代谢和甲酸盐/阿尔达酸盐代谢途径中,DEGs被显著丰富.
- 降低了视网醇脱酶12样 (rdh12样),氧化酶 (pdxk) 和规素 (rgn) 的抑制,降低了后代化率. 此外,Innexin 2 (inx2) 的淘汰也降低了化率.
结论:
- 基因rdh12-like,pdxk,rgn和inx2都与Z. tau的丸发育和精子生成有关.
- 这些已识别的基因在整个tephritid物种中显示保存的功能,这表明了对更广泛的害虫控制应用的潜力.
- 这些发现为丸发育的分子机制和tephritid害虫中的精子生成提供了宝贵的见解.
