在酸盐过氧化酶化合物II中与光谱学相关的结构
Mursaleem Ansari1, Sinjini Bhattacharjee1, Dimitrios A Pantazis1
1Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Kaiser-Wilhelm-Platz 1, Mülheim an der Ruhr 45470, Germany.
对酸盐过氧化酶 (APX) 化合物II的光谱数据强烈支持铁氧形式,而不是铁氧. 这解决了有关该酶关键中间体的相互矛盾的实验结果.
科学领域:
- 生物化学
- 计算化学
- 光谱学
背景情况:
- 酸盐过氧化酶 (APX) 对于植物的防御至关重要.
- 在APX中的化合物II具有关键的铁 (IV) 中间体.
- 关于它的质子状态存在相互矛盾的结构和光谱数据.
研究的目的:
- 解决APX化合物II中铁的质子化状态.
- 为了协调晶体学和光谱学发现之间的差异.
主要方法:
- 面向光谱的量子力学/分子力学 (QM/MM) 计算.
- 广泛的外观空间探索.
- 结合集群计算 (DLPNO-CCSD) 进行验证.
- 对Mössbauer,XAS,NRVS,光学和X射线发射光谱的分析.
主要成果:
- 氧和形式的Fe-O距离属于不同的,不重叠的范围.
- 在QM/MM计算中,所有的光谱观测结果都被单独分配到一个铁O形式.
- 一个终端基组与光谱数据不一致.
- 结晶学Fe-O距离仅与类物种保持一致.
结论:
- APX化合物II的铁O配方得到了光谱数据的强烈支持.
- 这些差异突显了研究中样本准备的潜在问题.
- 铁模型与光谱证据不相容.
更多相关视频
05:54Author Spotlight: Non-Invasive Imaging of Complex Bio-Structures Using Polarization-Sensitive Two-Photon Microscopy
Published on: September 8, 2023
10:21Developing Photosensitizer-Cobaloxime Hybrids for Solar-Driven H2 Production in Aqueous Aerobic Conditions
Published on: October 5, 2019
相关概念视频
UV–Vis Spectroscopy: Woodward–Fieser Rules
Molecular Spectroscopy: Absorption and Emission
UV–Vis Spectroscopy: Molecular Electronic Transitions
UV–Vis Spectroscopy of Conjugated Systems
One of the factors influencing λmax is the extent...
Spectroscopy of Carboxylic Acid Derivatives
IR and UV–Vis Spectroscopy of Carboxylic Acids
However, the stretching absorptions for the C=O bond vary depending on the structure of carboxylic acids. The C=O bond of the free carboxylic acids shows a higher stretching frequency, 1760 cm−1, while H-bonded carboxylic acids (dimers) exhibit stretching absorptions at a lower frequency,...
